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伍绍贵; 高晓彤; 李权; 廖杰; 徐成刚
分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用(英文)
Source Publication物理化学学报
KeywordF1-ATP合酶 氢键 分子动力学 突变
AbstractF1-ATP合酶通过与ATP之间建立广泛的相互作用,实现对ATP的位置进行精确的定位.这些相互作用为ATP的合成/水解创造了稳定的环境.理解这些相互作用是理解ATP的合成/水解机理的基础.我们通过分子动力学模拟方法研究这些相互作用,找出在稳定化过程中起到重要作用的残基.通过检测ATP和F1-ATP合酶之间的非键相互作用,发现残基段158–164所形成的loop区域及残基R189,Y345对ATP存在显著相互作用.其中,该loop区域对ATP的三磷酸部分形成一个半包围结构,封闭活性位点区域,并通过氢键网络约束ATP三磷酸的运动,为ATP合成/水解创造稳定的环境.此外,关键残基Y345通过π–π叠加相互作用对ATP的碱基进行约束,但是ATP的碱基可以在平行于Y345芳香环的平面内进行滑动,我们推断这种滑动运动有利于促进ATP的水解.
2015
Volume31Issue:09Pages:1803-1809
Indexed ByCSCD
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Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.itp.ac.cn/handle/311006/25643
CollectionCNKI期刊论文
Affiliation1.四川师范大学化学与材料科学学院
2.中国科学院理论物理研究所理论物理国家重点实验室
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GB/T 7714
伍绍贵,高晓彤,李权,等. 分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用(英文)[J]. 物理化学学报,2015,31(09):1803-1809.
APA 伍绍贵,高晓彤,李权,廖杰,&徐成刚.(2015).分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用(英文).物理化学学报,31(09),1803-1809.
MLA 伍绍贵,et al."分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用(英文)".物理化学学报 31.09(2015):1803-1809.
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