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中国科学院理论物理研究所机构知识库
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ProALIGN: Directly Learning Alignments for Protein Structure Prediction via Exploiting Context-Specific Alignment Motifs
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2022
作者:
Kong, Lupeng
;
Ju, Fusong
;
Zheng, Wei-mou
;
Zhu, Jianwei
;
Sun, Shiwei
;
Xu, Jinbo
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(3588Kb)
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提交时间:2023/01/16
SERVER
Manipulated deformation of lipid bilayer vesicles in magnetic fields
期刊论文
LIQUID CRYSTALS, 2022
作者:
Shu, Yao-Gen
;
Ou-Yang, Zhong-Can
Adobe PDF(1439Kb)
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浏览/下载:168/0
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提交时间:2023/01/16
CURVATURE ELASTICITY
SPHERICAL VESICLE
BENDING ENERGY
NANOTUBES
MEMBRANES
SPHERES
SHAPES
PHASE
2ND
Seq-SetNet: directly exploiting multiple sequence alignment for protein secondary structure prediction
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 4, 页码: 990-996
作者:
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Zhang, Qi
;
Wei, Guozheng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(700Kb)
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提交时间:2023/01/16
RECOGNITION
FRAGMENTS
FOLD
CopulaNet: Learning residue co-evolution directly from multiple sequence alignment for protein structure prediction
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 卷号: 12, 期号: 1, 页码: 2535
作者:
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Shao, Bin
;
Kong, Lupeng
;
Liu, Tie-Yan
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(1959Kb)
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提交时间:2021/09/27
CONTACTS
POTENTIALS
ISSEC: inferring contacts among protein secondary structure elements using deep object detection
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 503
作者:
Zhang, Qi
;
Zhu, Jianwei
;
Ju, Fusong
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(1906Kb)
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提交时间:2021/09/27
HELIX-HELIX INTERACTIONS
INVERSE COVARIANCE ESTIMATION
RESIDUE CONTACTS
BETA-SHEETS
PREDICTION
MEMBRANE
Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 135
作者:
Wang, C
;
Wei, Y
;
Zhang, HC
;
Kong, LP
;
Sun, SW
;
Zheng, WM
;
Bu, DB
Adobe PDF(1618Kb)
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提交时间:2019/07/19
TERTIARY STRUCTURES
FRAGMENTS
Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling
会议论文
BMC BIOINFORMATICS, Wuhan, PEOPLES R CHINA, JAN 14-16, 2019
作者:
Wang, C
;
Wei, Y
;
Zhang, HC
;
Kong, LP
;
Sun, SW
;
Zheng, WM
;
Bu, DB
Adobe PDF(1618Kb)
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浏览/下载:352/0
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提交时间:2019/07/24
TERTIARY STRUCTURES
FRAGMENTS
Phase Behaviors of Ionic Liquids Heating from Different Crystal Polymorphs toward the Same Smectic-A Ionic Liquid Crystal by Molecular Dynamics Simulation
期刊论文
CRYSTALS, 2019, 卷号: 9, 期号: 1, 页码: 26
作者:
Cao, WD
;
Wang, YT
Adobe PDF(4363Kb)
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提交时间:2019/07/19
SPATIAL HETEROGENEITY
ATOMIC CHARGES
CHAIN-LENGTH
TRANSITION
INSIGHTS
DIFFUSION
STATE
Comparing NMR and X-ray protein structure: Lindemann-like parameters and NMR disorder
期刊论文
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2018, 卷号: 36, 期号: 9, 页码: 2331-2341
作者:
Faraggi, E
;
Dunker, AK
;
Sussman, JL
;
Kloczkowski, A
Adobe PDF(703Kb)
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提交时间:2018/12/27
BACKBONE TORSION ANGLES
MAJOR URINARY PROTEIN
INTRINSIC DISORDER
STRUCTURE PREDICTION
SECONDARY STRUCTURE
CRYSTAL-STRUCTURE
DYNAMICS
DIFFRACTION
CRYSTALLOGRAPHY
RECOGNITION
Anchor Effect of Interactions Between Kinesin's Nucleotide-Binding Pocket and Microtubule
期刊论文
CELLULAR AND MOLECULAR BIOENGINEERING, 2017, 卷号: 10, 期号: 2, 页码: 162-173
作者:
Jin, YM
;
Geng, YZ
;
Lu, LN
;
Ma, YL
;
Lu, G
;
Zhang, H
;
Ji, Q
;
Geng, YZ (reprint author), Hebei Univ Technol, Sch Sci, Tianjin 300401, Peoples R China.
;
Ji, Q (reprint author), Chinese Acad Sci, Inst Theoret Phys, State Key Lab Theoret Phys, Beijing 100190, Peoples R China.
Adobe PDF(5968Kb)
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提交时间:2017/12/21
Kinesin
Microtubule
Nucleotide-binding Pocket
Anchor Effect