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中国科学院理论物理研究所机构知识库
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ProALIGN: Directly Learning Alignments for Protein Structure Prediction via Exploiting Context-Specific Alignment Motifs
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2022
作者:
Kong, Lupeng
;
Ju, Fusong
;
Zheng, Wei-mou
;
Zhu, Jianwei
;
Sun, Shiwei
;
Xu, Jinbo
;
Bu, Dongbo
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提交时间:2023/01/16
SERVER
Seq-SetNet: directly exploiting multiple sequence alignment for protein secondary structure prediction
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 4, 页码: 990-996
作者:
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Zhang, Qi
;
Wei, Guozheng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(700Kb)
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浏览/下载:74/0
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提交时间:2023/01/16
RECOGNITION
FRAGMENTS
FOLD
Lateral predictive coding revisited: internal model, symmetry breaking, and response time
期刊论文
COMMUNICATIONS IN THEORETICAL PHYSICS, 2022, 卷号: 74, 期号: 9, 页码: 95601
作者:
Huang, Zhen-Ye
;
Fan, Xin-Yi
;
Zhou, Jianwen
;
Zhou, Hai-Jun
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提交时间:2023/01/16
BRAIN
CopulaNet: Learning residue co-evolution directly from multiple sequence alignment for protein structure prediction
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 卷号: 12, 期号: 1, 页码: 2535
作者:
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Shao, Bin
;
Kong, Lupeng
;
Liu, Tie-Yan
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(1959Kb)
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提交时间:2021/09/27
CONTACTS
POTENTIALS
Network dismantling on factor graphs: break long loops and spare local structures
期刊论文
NEW JOURNAL OF PHYSICS, 2021, 卷号: 23, 期号: 10, 页码: 103014
作者:
Li, Tianyi
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提交时间:2023/01/16
Long-loop feedback vertex set and dismantling on bipartite factor graphs
期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2021, 卷号: 103, 期号: 6, 页码: L061302
作者:
Li, Tianyi
;
Zhang, Pan
;
Zhou, Hai-Jun
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浏览/下载:181/0
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提交时间:2021/09/27
COMMUNITY STRUCTURE
COMPLEX NETWORKS
Balanced biosynthesis and trigger threshold resulting in a double adder mechanism of cell size control
期刊论文
COMMUNICATIONS IN THEORETICAL PHYSICS, 2021, 卷号: 73, 期号: 8, 页码: 85601
作者:
Li, Leilei
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提交时间:2021/09/27
ESCHERICHIA-COLI
CHROMOSOME-REPLICATION
PROTEIN-DEGRADATION
GROWTH
HOMEOSTASIS
DIVISION
INITIATION
CYCLE
ADAPTATION
BACTERIA
Covering Problems and Core Percolations on Hypergraphs
期刊论文
PHYSICAL REVIEW LETTERS, 2020, 卷号: 124, 期号: 24, 页码: 248301
作者:
Coutinho, Bruno Coelho
;
Wu, Ang-Kun
;
Zhou, Hai-Jun
;
Liu, Yang-Yu
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提交时间:2020/11/26
SET
ISSEC: inferring contacts among protein secondary structure elements using deep object detection
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 503
作者:
Zhang, Qi
;
Zhu, Jianwei
;
Ju, Fusong
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(1906Kb)
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提交时间:2021/09/27
HELIX-HELIX INTERACTIONS
INVERSE COVARIANCE ESTIMATION
RESIDUE CONTACTS
BETA-SHEETS
PREDICTION
MEMBRANE
Trade-offs between effectiveness and cost in bifunctional enzyme circuit with concentration robustness
期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2020, 卷号: 101, 期号: 1, 页码: 12409
作者:
Guan, Shaohua
;
Xu, Liufang
;
Zhang, Qing
;
Shi, Hualin
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提交时间:2020/06/16
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