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中国科学院理论物理研究所机构知识库
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ProALIGN: Directly Learning Alignments for Protein Structure Prediction via Exploiting Context-Specific Alignment Motifs
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2022
作者:
Kong, Lupeng
;
Ju, Fusong
;
Zheng, Wei-mou
;
Zhu, Jianwei
;
Sun, Shiwei
;
Xu, Jinbo
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(3588Kb)
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提交时间:2023/01/16
SERVER
Seq-SetNet: directly exploiting multiple sequence alignment for protein secondary structure prediction
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 4, 页码: 990-996
作者:
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Zhang, Qi
;
Wei, Guozheng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(700Kb)
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浏览/下载:74/0
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提交时间:2023/01/16
RECOGNITION
FRAGMENTS
FOLD
Origin of the Surprising Mechanical Stability of Kinesin's Neck Coiled Coil
期刊论文
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, 2021, 卷号: 17, 期号: 2, 页码: 1017-1029
作者:
Liu, Shu-Xia
;
Lu, Gang
;
Zhang, Hui
;
Geng, Yi-Zhao
;
Jix, Qing
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提交时间:2021/09/27
Folding nucleus and unfolding dynamics of protein 2GB1
期刊论文
CHINESE PHYSICS B, 2021, 卷号: 30, 期号: 2, 页码: 28703
作者:
Wei, Xuefeng
;
Wang, Yanting
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提交时间:2021/09/27
CopulaNet: Learning residue co-evolution directly from multiple sequence alignment for protein structure prediction
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 卷号: 12, 期号: 1, 页码: 2535
作者:
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Shao, Bin
;
Kong, Lupeng
;
Liu, Tie-Yan
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
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提交时间:2021/09/27
CONTACTS
POTENTIALS
ISSEC: inferring contacts among protein secondary structure elements using deep object detection
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 503
作者:
Zhang, Qi
;
Zhu, Jianwei
;
Ju, Fusong
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
Adobe PDF(1906Kb)
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提交时间:2021/09/27
HELIX-HELIX INTERACTIONS
INVERSE COVARIANCE ESTIMATION
RESIDUE CONTACTS
BETA-SHEETS
PREDICTION
MEMBRANE
Multiscale computational prediction of beta-sheet peptide self-assembly morphology
期刊论文
MOLECULAR SIMULATION, 2020, 页码: 暂无
作者:
Deng, Li
;
Wang, Yanting
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提交时间:2020/06/16
MOLECULAR-DYNAMICS METHOD
INTERMOLECULAR FORCES
PROTEIN AGGREGATION
NANOMECHANICS
POLYMORPHISM
SIMULATIONS
TRANSITIONS
NANOTUBES
FIBRILS
SOLVENT
Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 135
作者:
Wang, C
;
Wei, Y
;
Zhang, HC
;
Kong, LP
;
Sun, SW
;
Zheng, WM
;
Bu, DB
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提交时间:2019/07/19
TERTIARY STRUCTURES
FRAGMENTS
DCA for genome-wide epistasis analysis: the statistical genetics perspective
期刊论文
PHYSICAL BIOLOGY, 2019, 卷号: 16, 期号: 2, 页码: 26002
作者:
Gao, CY
;
Cecconi, F
;
Vulpiani, A
;
Zhou, HJ
;
Aurell, E
Adobe PDF(1652Kb)
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提交时间:2019/07/19
DIRECT-COUPLING ANALYSIS
PROTEIN-STRUCTURE
CONTACTS
HIV
IDENTIFICATION
RECOMBINATION
LINKAGE
LANDSCAPE
INFERENCE
MODEL
Correction to: Predicting protein inter-residue contacts using composite likelihood maximization and deep learning (vol 20, 537, 2019)
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 616
作者:
Zhang, Haicang
;
Zhang, Qi
;
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Gao, Yujuan
;
Xie, Ziwei
;
Deng, Minghua
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
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提交时间:2020/06/16