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中国科学院理论物理研究所机构知识库
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Comparing NMR and X-ray protein structure: Lindemann-like parameters and NMR disorder
期刊论文
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2018, 卷号: 36, 期号: 9, 页码: 2331-2341
作者:
Faraggi, E
;
Dunker, AK
;
Sussman, JL
;
Kloczkowski, A
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提交时间:2018/12/27
BACKBONE TORSION ANGLES
MAJOR URINARY PROTEIN
INTRINSIC DISORDER
STRUCTURE PREDICTION
SECONDARY STRUCTURE
CRYSTAL-STRUCTURE
DYNAMICS
DIFFRACTION
CRYSTALLOGRAPHY
RECOGNITION
Reoptimized UNRES Potential for Protein Model Quality Assessment
期刊论文
GENES, 2018, 卷号: 9, 期号: 12, 页码: 601
作者:
Faraggi, E
;
Krupa, P
;
Mozolewska, MA
;
Liwo, A
;
Kloczkowski, A
Adobe PDF(1129Kb)
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提交时间:2019/07/19
RESIDUE FORCE-FIELD
KNOWLEDGE-BASED POTENTIALS
ACCESSIBLE SURFACE-AREA
STRUCTURE PREDICTION
MOLECULAR-DYNAMICS
STATISTICAL POTENTIALS
STRUCTURE SIMULATIONS
POLYPEPTIDE-CHAINS
SCORING FUNCTION
WEB SERVER
MQAPsingle: A quasi single-model approach for estimation of the quality of individual protein structure models
期刊论文
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2016, 卷号: 84, 期号: 8, 页码: 1021-1028
作者:
Pawlowski, M
;
Kozlowski, L
;
Kloczkowski, A
;
Kloczkowski, A (reprint author), Nationwide Childrens Hosp, Res Inst, Battelle Ctr Math Med, 700 Childrens Dr, Columbus, OH 43205 USA.
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提交时间:2017/10/13
Model Quality Assessment
Protein Structure
Protein Prediction
Mqap
Single-model Mqap
Model Correctness
Casp10
Conditional entropy in variation-adjusted windows detects selection signatures associated with expression quantitative trait loci (eQTLs)
期刊论文
BMC GENOMICS, 2015, 卷号: 16, 期号: 0, 页码: S8
作者:
Handelman, SK
;
Seweryn, M
;
Smith, RM
;
Hartmann, K
;
Wang, DX
;
Pietrzak, M
;
Johnson, AD
;
Kloczkowski, A
;
Sadee, W
;
Handelman, SK (reprint author), Ohio State Univ, Coll Med, Ctr Pharmacogen, Graves Hall,330 W 10th Ave, Columbus, OH 43210 USA.
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提交时间:2016/11/21
Accurate single-sequence prediction of solvent accessible surface area using local and global features
期刊论文
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2014, 卷号: 82, 期号: 11, 页码: 3170-3176
作者:
Faraggi, E
;
Zhou, YQ
;
Kloczkowski, A
;
Faraggi, E (reprint author), Indiana Univ Sch Med, Dept Biochem & Mol Biol, Indianapolis, IN 46202 USA.
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提交时间:2015/06/03
Protein Secondary Structure
Backbone Torsion Angles
Real-value Prediction
Regression